Western 免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进行检测的实验。在WB 实验中常会出现各种问题,而拖慢实验速度,使实验达不到理想的效果。今天百萤跟各位同学一起分享下 WB 实验中各种问题及问题建议。
常见问题 |
可能原因 |
建议 |
电泳条带成笑脸状 |
胶不均匀冷切,中间冷却不好,电泳系统温度偏高 |
减少电压减慢电泳速度,在冷室或者冰浴中进行电泳 |
电泳条带成皱眉状 |
可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全 |
调整装置 |
拖尾 |
样品溶解不好 |
样品充分溶解混匀后上样 |
纹理(纵向条纹) |
样品中含有不溶性颗粒 |
样品充分搅拌混匀 |
条带偏斜 |
电极不平衡或者加样位置偏斜 |
调整电极和加样 |
条带两边扩散 |
加样量过多 |
适当减少上样量 |
Marker 变黑色 |
抗体和 Marker 蛋白反应 |
在 Marker 和 sample 之间空出一个孔不上样 |
背景高 |
膜封闭不够 |
延长封闭时间,选择适宜的抗体稀释度 |
一抗稀释度不适宜 |
对抗体进行滴度测试,选择适宜的抗体稀释度 |
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一抗孵育的温度偏高 |
建议 4℃ 结合过夜 |
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二抗浓度度过高 |
降低二抗浓度 |
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二抗的非特异性背景 |
增加一个二抗对照,不加一抗,其他操作过程不变,即可验证背景是否是由于二抗所致。可选择其它二抗(特异性更强的,只针对重链) |
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二抗孵育时间过久 |
减少二抗孵育时间 |
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选择膜的问题 |
硝酸纤维素的背景会比 PVDF 膜低 |
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膜在实验过程中干过 |
实验过程中要注意保持膜的湿润 |
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检测时曝光时间过长 |
注意曝光时间的缩短 |
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洗膜不充分 |
增加洗膜的时间和次数 |
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抗体和封闭蛋白有交叉反应 |
检测抗体与封闭蛋白的交叉反应性,选择无交叉反应的封闭剂。洗涤液中加入 Tween-20 可减少交叉反应 |
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杂带较多 |
目的蛋白有多个修饰位点(磷酸化位点,糖基化位点,乙酰化位点等),本身可以呈现多条带 |
查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白试剂大小 |
目的蛋白有其他剪切本 |
查阅文献或生物信息学分析可能性 |
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样品处理过程中目的蛋白发生降解 |
裂解液中加入蛋白酶抑制剂,样品处理在冰上进行 |
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上样量过高,太敏感 |
适当减少上样量 |
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一抗不纯 |
纯化抗体 |
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一抗特异性不高 |
重新选择或制备高特异性的抗体 |
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二抗的非特异性结合 |
增加一个二抗对照,不加一抗,其他操作过程不变,即可验证背景是否是由于二抗所致。可选择其它二抗(特异性更强的,只针对重链) |
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一抗或二抗浓度偏高 |
降低抗体浓度 |
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细胞传代较多,导致蛋白变异 |
使用原代或传代少的细胞作对照 |
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蛋白条带位置 (大小)不对 |
二聚体或多聚体存在 |
增加蛋白质变性过程及强度 |
翻译后剪切 |
比如很多蛋白是以前体蛋白的形式合成的,在执行功能时需要进行剪切成活化的形式 |
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相对电荷 |
氨基酸电荷的组成 |
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蛋白修饰 |
比如糖基化、磷酸化等修饰状态会导致蛋白分子量增加 |
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胶浓度 |
不同浓度的胶跑出的蛋白条带的位置可能有所偏差 |
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无蛋白条带 |
抗体孵育不充分 |
增加抗体浓度,延长孵育时间 |
酶失活 |
直接将酶和底物进行混合,如果不显色则说明酶失活了。选择在有效期内、有活性的酶联物 |
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标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低 |
设置阳性对照,如果阳性对照有结果,但标本没有则可能是标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考虑增加标本上样量解决靶蛋白含量低的原因 |
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试剂之间不匹配 |
一抗与组织种属,一抗与二抗或/和底物与酶系统之间不匹配。通过设置内参照可以验证二级检测系统的有效性 |
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一抗失效 |
选择在有效期内抗体,幷选择现配现用的工作液 |
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HRP 抑制剂 |
所用溶液和容器内避免含有叠氮化钠 |
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抗体不能识别测试种属的相关蛋白 |
购买抗体前应认真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白 |
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二抗与一抗不匹配 |
选择针对一抗来源种属的抗体 |
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蛋白条带信号弱 |
抗体孵育不充分 |
增加抗体浓度,延长孵育时间 |
酶活性降低 |
直接将酶和底物进行混合,如果不显色则说明酶失活了。选择在有效期内、有活性的酶联物 |
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洗膜过度 |
洗膜时间不宜过长,加入的去垢剂不宜过强或过多,建议使用 0.1% 的弱去垢剂 Tween-20 |
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标本中靶蛋白含量太低 |
增加样本上样量 |
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抗体活性降低 |
选择有效期内的抗体,工作液现配现用,避免长时间放置 |
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蛋白转移不充分 |
可以用丽春红染膜幷结合染胶(考马斯蓝)后确定条带是否转移到膜上或转移过度,适当调整转膜的时间和电流 |
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封闭过度 |
减少封闭剂的量或缩短时间,换用不同封闭剂类型 |
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曝光时间过短 |
延长曝光时间 |
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HRP 抑制剂 |
所用溶液和容器内避免含有叠氮化钠 |
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背景有黑色斑点 |
抗体与封闭试剂反应 |
使用前过滤封闭试剂 |
HRP 偶联二抗中有聚集体 |
过滤二抗试剂,去除聚集体 |
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暗背景上白色带 |
HRP 含量过高 |
降低酶联二抗的浓度 |
背景有不均匀的白色斑点 |
转膜过程中有气泡存在 |
仔细检测,避免存在气泡 |
抗体分布不均匀 |
孵育抗体时使用摇床 |
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