2016生物信息学与药物设计研讨会▪中国(重庆)
盛夏时节逢盛会,荷花飘香迎嘉宾。2016年7月29至31日,“第二届生物信息学与药物设计研讨会”在重庆大学虎溪校区图书馆隆重召开。本届大会围绕“生物信息大数据处理与计算机辅助药物设计”这一主题,重点探讨了大数据背景下精准医疗的发展,并深入交流了新药发现的新思路和新技术。大会由上海市生物信息学会与重庆市生物信息学会(筹)主办,重庆大学药学院承办。来自重庆大学、美国北卡罗来纳大学、美国国立卫生研究院、新加坡国立大学、中科院上海生科院、中科院上海药物所、浙江大学、复旦大学、上海交通大学、同济大学等国内外知名高校和科研单位的140余名师生参加了本次大会。
第一部分:大会开幕式
重庆大学校长助理夏之宁教授作为特邀嘉宾出席了大会,并代表重庆大学致开幕辞。重庆大学药学院主任,国家“千人计划”专家贺耘教授代表会议承办单位致欢迎辞。开幕式由国家“青年千人计划”入选者,重庆大学药学院主任助理朱峰教授主持。
重庆大学校长助理,教育部“跨世纪优秀人才”专家,国务院政府特殊津贴获得者,重庆大学药学院教授 夏之宁
夏之宁教授作为特邀嘉宾出席了大会,并代表重庆大学致开幕辞。夏教授向各位来宾隆重介绍了重大建立“完备弘深之大学”的历史使命和“研究学术、造就人才、佑启乡邦、振导社会”的办学宗旨,并借用《滕王阁序》中的“登高作赋,是所望于群公”向本届大会提出了殷切期望。
国家“千人计划”专家,重庆市“百人计划”专家,中美生物技术与制药协会会长,重庆大学药学院主任 贺耘
贺耘教授作为特邀嘉宾出席了大会,并代表会议承办单位致欢迎辞。贺教授回顾了重庆大学药学学科在校领导的全力支持下所实现的跨越式发展,从人才梯队和学科组成等多个方面详细介绍了药学院的现状,让与会专家深切感受到了药学院作为重大新建学院的蓬勃生机和光明前景。
国家“青年千人计划”专家,中国化学会计算机化学委员会委员,重庆大学药学院主任助理 朱峰
作为本届大会组委会总负责人,朱峰教授向各位与会专家热情介绍了专程来渝参会的国家“杰青”获得者,教育部长江学者,四川大学华西药学院秦勇教授,并作为大会开幕式主持人安排了整个大会进程。
第二部分:大会报告
大会报告各位专家分别从大数据与精准医学、传统中草药研究和药物设计与发现等不同角度,深入剖析了生物信息学与药物设计领域的最新科研进展,强调要充分发挥生物信息学科的基础性作用,重视生物医药大数据的收集与分析,不断推进我国医药行业的健康发展。大会报告现场气氛活跃,互动积极,为各位参会老师和同学们带来了难得的学术视听盛宴。
上海生物信息技术研究中心主任,上海市生物信息学会理事长,中科院上海生命科学研究院研究员 李亦学
作为本届大会学术委员会主席,李亦学研究员围绕国家“十三五”规划重大基础设施项目的建设,发表了题为“国家生物医学大数据基础设施”的精彩报告。他认为我们要重视医疗体系中的大数据,充分挖掘其潜在的应用价值,为精准医疗奠定基础,从而更好地服务于人类的健康事业。
国家“千人计划”专家,新加坡国立大学药学院教授 陈宇综
作为本届大会学术委员会副主席,陈宇综教授以屠呦呦对青蒿素的发现为案例深刻地探讨了从传统和现代医药中发掘新药的新思路和新方法,探索如何应用现代科学方法从中药和西药中寻找发现新药的线索,发现和鉴别出新药源和新药靶,从而让世界更好地认识和了解中药的价值。
中科院“百人计划”专家,上海市“浦江人才”专家,中科院上海药物研究所研究员 朱维良
作为本届大会学术委员会副主席,朱维良研究员发表了题为“卤键及其在药物发现和设计中的应用”的精彩报告。报告从有机卤键的基本概念、有机卤键在解释药物-受体相互作用、在成药性评价以及虚拟筛选等几个方面展开,重点阐述了有机卤键在药物发现与设计中的重要意义。
第三部分:邀请报告
大会报告后,各位专家进一步开展了丰富的学术交流,众多国内外著名的领域内专家分享了他们在科学研究中的宝贵心得,不仅深入介绍了各自的突破性研究成果,还与各位参会老师和同学开展了广泛的学术交流和互动。。
浙江大学“求是”特聘教授,中国化学会计算机化学委员会秘书长,浙江大学药学院教授 侯廷军
评价了MM/PBSA和MM/GBSA在结合自由能计算方面的预测性能,发现不同模型、力场参数和介电常数均对两者的预测性能有显著的影响。
中科院“百人计划”专家,上海市“浦江人才”专家,复旦大学生物医学研究院教授 刘雷
对原发性肝细胞癌的代谢组和转录组数据进行分析,发现了相应的生物标志物,运用这些标志物对病患的分类表现出了显著的生存差异。
中国医药科技成果转化中心重庆分中心主任,高圣医药董事长,威斯腾生物医药科技有限责任公司董事长 周勇
高创汇是一个以原创新药孵化平台、新药研发服务、新药研发链式公共服务平台作为平台主营业务的互联网载体,采用线上与线下的无缝结合。
国家自然科学基金“优青”获得者,中国化学会计算化学委员会委员,上海交通大学医学院医药生物信息学中心主任、教授 张健
通过生物信息学与化学生物学手段分析了存在变构效应的各种蛋白的特征,发现了变构调控药物的基本特征,为该类药物的合理设计奠定了基础。
上海市生物信息学会理事,教育部“新世纪优秀人才”专家,同济大学生命科学与技术学院教授 曹志伟
探讨了其课题组在运用组合药物协同作用开展癌症治疗方向上的最新研究进展,该发现在临床研究中已经显示出了良好的临床效果。
中国化学会计算机化学专业委员会委员,教育部“新世纪优秀人才”专家,厦门大学生命科学学院教授 纪志梁
介绍了其在大范围大数据搜寻药物副作用领域的研究进展,通过采用计算机高通量搜寻方法,为精准医疗研究指出了新的研究方向。
上海市“浦江人才”专家,同济大学生命科学与技术学院教授 江赐忠
揭示了Oct4在体细胞重编程的表观遗传重排过程中的完整分子路线图,为下一步的重编程研究提供了丰富的研究资源。
中国化学会计算机化学专业委员会委员,吉林大学理论化学计算所教授 郑清川
介绍了CYP家族重要蛋白对底物的选择性及其催化机理,清晰地阐明了CYP家族蛋白对底物的选择性,基于此提出了该类药物设计和优化的思路和方法。
美国北卡罗来纳大学助理教授 姚丽霞
提出了用于衡量医药产业投入与需求关系的新型指数——健康科研机会指数(Health Research Opportunity Index),并指出乳腺癌是被过度投入的典型疾病。
浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室副主任,教育部“新世纪优秀人才”专家,浙江大学药学院教授 陈新
揭示了组学技术与表型效应之间的复杂关系,从生物功能的层面理解疾病的发病机制和有效的治疗方案,对开发新型疾病干预方法具有指导意义。
美国国家生物技术信息中心高级科学家 韩涟漪
介绍了其团队最新构建的结合序列标记化(tokenization)技术和现代搜索引擎的组合序列比对方法,该方法大大提高了蛋白质序列相似性搜索的效率。
南京大学配位化学国家重点实验室教授,南京大学化学化工学院教授 汪蓉
介绍了其课题组在DNA诱导的纳米粒子装配方向的研究工作,该工作通过分子动力学模拟发现了控制DNA功能化纳米粒子自组装和结晶化的关键温度。
人工智能与模式识别专业委员会委员,生物信息学专业组委员,生物信息学与人工生命专委会委员,天津大学计算机学院教授 邹权
介绍了其开发的LibD3C在线分类服务器,该分类器可以在不依赖于参数调节的基础上,处理不平衡的正负数据集,并达到良好的分类效果。
重庆大学“百人计划”专家,重庆大学化学化工学院研究员 蓝宇
分享了其课题组在计算化学方向的创新性研究工作,重点介绍了其运用计算手段在构建季碳中心和立体化学方向上的丰硕研究成果。
重庆邮电大学生物信息学院院长、教授 舒坤贤
从高通量蛋白组学研究出发,介绍了其在整合蛋白组资源方向上的开创性研究成果——iProX,一个用于整合现有蛋白组学数据的网络数据库。
第三军医大学基础医学部生物信息学中心主任、教授 邹凌云
介绍了其构建的网络在线服务器T4EffPred,该服务器主要运用支持向量机方法在基因组层面预测Type IV细菌的secreted effectors。
杭州师范大学医学院教授 陶林
阐述了其研究方向——研究并发现所有天然药物在全化学空间中的聚类分布现象,并指出医药工业相关从业者将对该发现有着广泛的兴趣。
第四部分:后记
生物信息学对蛋白质和核酸功能的研究,为新药开发提供了全新的思路,特别是为药物设计中先导化合物的发现、药物靶标的发现、药物与靶点的相互作用等提供了全新的研究手段。本届会议的成功举办为各位专家学者提供了一个共同探讨和交流的平台,促进了生物信息学与药物设计研究的有机结合和协作。