端粒酶重复片段扩增试剂盒(TRAP试剂盒)-RNAi技术-试剂-生物在线
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端粒酶重复片段扩增试剂盒(TRAP试剂盒)

端粒酶重复片段扩增试剂盒(TRAP试剂盒)

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产品名称: 端粒酶重复片段扩增试剂盒(TRAP试剂盒)

英文名称: Telomeric Repeat Amplification Protocol Kit

产品编号: HZ111009

产品价格: 0

产品产地: 中国/上海

品牌商标: 沪震生物

更新时间: 2023-08-17T10:24:20

使用范围: null

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 端粒酶重复片段扩增试剂盒(TRAP试剂盒)

中文名称:端粒酶重复片段扩增试剂盒(TRAP试剂盒)
英文名称:Telomeric Repeat Amplification Protocol Kit
产品规格:50次
本品是我司在经典TRAP技术基础上改良而得,专门用于快速测定人类细胞端粒酶的相对活性(需要跟对照样品比较)。端粒酶存在于85-90%的肿瘤组织中,因此通过检测端粒酶活性就能早期诊断大多数肿瘤。目前最常用的检测端粒酶活性的方法就是TRAP,它利用端粒酶能在外加的TS模板DNA的末端添加不同数量的TTAGGG序列这一特点,通过PCR检测延伸产物而高效检测端粒酶活性。原理如下:
TRAP原理图

产品特点:
1.一站式,提供从细胞裂解到PCR的所有试剂,但不含PAGE和银染试剂。
2.一管式操作,端粒酶延伸和PCR在同一体系中完成,方便快捷。
3.提供改良的、长为150bp的内参和含8个端粒序列的合成端粒,可有效排除PCR假阴性。内参长度远大于TRAP产物,不会干扰结果分析。
4.改良的TS模板和PCR引物,极大降低了引物二聚体的形成。
5.既可用于培养细胞,也可用于实体组织。
6.灵敏度高,最低可以检测到10个肿瘤细胞中的端粒酶活性。

试剂盒组成:

成分 规格
TRAP细胞裂解液 10mL
PCR Mix 3.0 1.5mL
合成端粒(PC) 50μL
TS-引物混合物(含内参) 300μL
超纯水 1mL
说明书 1份



储存条件:低温运输,-20℃保存,有效期一年。

使用方法:

一、端粒酶的提取
注意:端粒酶是蛋白质和RNA组成的复合体,RNA极容易被降解,因此,提取端粒酶应该跟提取RNA一样,尽量在低温条件下快速操作,并且必须使用RNase-free的耗材,桌面最好用固相RNase清除剂清洁(BTN3090)清洁。
1.对冷冻的实体组织:将50-100mg冷冻组织在液氮中用预冷的研磨器研磨成粉末,再转移到预冷的玻璃匀浆器中,加入200μl预冷的TRAP细胞裂解液,温和手动匀浆数次后冰浴30分钟,每间隔数分钟涡旋振荡一次,共5-6次,然后直接进入第3步操作。为保证裂解效果,可在显微镜下观察。如果组织样品不足50-100mg,可以按比例降低TRAP细胞裂解液的用量。
2.对新鲜的培养细胞和组织:用自备的预冷PBS洗涤105-106个经过胰酶处理的细胞或50-100mg新鲜组织,3000g 4℃离心5分钟,弃上清;加入200μL预冷的TRAP细胞裂解液悬浮细胞或组织。对细胞:涡旋振荡10秒后置冰浴30分钟,每间隔数分钟涡旋振荡一次,共5-6次。对组织:在冰上用玻璃匀浆器轻柔匀浆后冰浴30分钟,每间隔数分钟涡旋振荡一次,共5-6次。如果细胞不足1×106或50-100mg,可按比例降低TRAP裂解液的用量。
3.12000-14000g 4℃离心20分钟。
4.收集160μL上清,先取部分用于测定蛋白质浓度,可通过测定215nm和225nm的光吸收得到,计算公式是蛋白质浓度(μg/μL)=0.144×(A215-A225)×稀释倍数,也可使用BCA法测定蛋白浓度。本试剂盒制备的细胞裂解物的蛋白浓度一般在10-750 ng/μL。知道各样品的蛋白浓度后,可用TRAP细胞裂解液将各样品的蛋白浓度调成一样便于比较,然后按10μL/管分装得到至少15管裂解物,放-80℃冷冻保存(可存放一年)。每个样品可取一管进行热灭活(95℃处理10分钟)后再放-80℃冷冻保存,此管将作为该样品的阴性对照。

二、TRAP反应
5.确定每个TRAP反应的细胞裂解物用量:为便于分析比较,每个TRAP反应所用的蛋白量(或细胞数)必须一样。由于细胞裂解物中一般都有高浓度的不明Taq DNA聚合酶抑制物(TRAP失败最常见的原因),因此最佳结果往往是用稀释10-1000倍后的细胞裂解物得到。建议用一个样品稀释不同浓度做TRAP预实验。
6.在PCR管中按下表设置TRAP反应(50μL反应体系,以A和B两个样品为例):

成份 A样品管 A阴性
对照管
B样品管 B阴性
对照管
实验
阴性对照
实验
阳性对照
A样品 2μl - - - - -
A阴性对照 - 2μl - - - -
B样品 - - 2μl - - -
B阴性对照 - - - 2μl - -
TRAP细胞裂解液 - - - - 2μl -
合成端粒 - - - - - 2μl
TS引物混合物 6μl 6μl 6μl 6μl 6μl 6μl
PCR Mix 25μl 25μl 25μl 25μl 25μl 25μl
超纯水 17μl 17μl 17μl 17μl 17μl 17μl


 注:为避免污染,最好等其他样品加完并盖上盖后再加合成端粒。
7.吹打混匀后进行PCR扩增,扩增条件(仅供参考,用户可优化)如下:

步骤 温度 时间
端粒酶延伸 30℃ 30min
端粒酶灭活 95℃ 5min
PCR(循环35次) 94℃ 30s
55℃ 60s
72℃ 30s



三、PAGE-银染检测及结果解读(本试剂盒不含PAGE-银染检测试剂盒)
8.取5μL PCR反应液进行10%非变性PAGE电泳-银染显色实验(需另购本公司PAGE电泳套装和银染试剂盒)。如果背景高(主要是由反应体系中的蛋白成分引起),可以先进行PCR产物纯化再进行PAGE电泳和银染。
9.跟预期结果(见下表)比较。如果结果跟下表不一致,则需要按具体情况分析原因。

现象 样品管结果 样品阴性
对照结果
实验阴性
对照结果
实验阳性
对照结果
典型TRAP条带
(条带数不限)
有则有端粒酶活性
无则无端粒酶活性
不出现 不出现 不出现
阳性对照的TRAP
条带(仅8条带)
不出现 不出现 不出现 出现
150bp内参 可出现可不出现 出现 出现 出现


 注:本试剂盒所用引物产生的典型TRAP条带最小条带为59bp。

疑难解答:
1.如果样品管有内参带,但没有TRAP条带,可能是端粒酶活性低或者失活。制备细胞裂解物时可在TRAP细胞裂解液中加入1/100体积的RNase抑制剂以抑制RNase活性,并在端粒延伸反应后增加DNA纯化一步,纯化后的DNA再用于PCR。此两步法TRAP需要用户自备DNA纯化试剂和dNTP。
2.如果样品对照管(端粒酶已经灭活)出现TRAP条带,可能是TRAP产物污染,需要使用洁净的PCR管和PCR试管架。样品制备、PCR设置和电泳需在不同房间进行。也可能是端粒酶没有彻底灭活,建议用RNase酶解法或酶解+热灭活法。
3.实验阴性对照管的实验结果中出现TRAP条带,可能是引物二聚体,可采取两步法TRAP,并且将DNA模板加入到70℃预热的PCR Mix3.0中再进行PCR。
4.实验结果不好时,可以直接采取2步法,先做端粒酶延伸和灭活,然后再纯化DNA,用纯化的DNA做PCR。此法需要用户自备dNTP。 

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