微生物基因组重测序
全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序，并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。重测序能够检测全基因组的罕见变异，可获得大量的单核苷酸多态性（SNP）信息、序列的插入缺失位点信息。
数字基因表达图谱分析
数字基因表达谱测序是用来研究某一生物对象在特定生物过程中基因表达差异的技术，该技术可广泛应用于生理调控、农业性状、生物标记、环境改造、疾病机制和药物筛选等领域。
基于转录组基因快速定位
BSA与RNA-seq相结合，不仅可开发出大量的SNP标记，且结合BSA能够精细定位单性状紧密连锁的分子标记及基因，并进行转录组分析，同时显著降低研究成本。
真菌基因组测序（比较基因组 基因功能 基因注释）
真菌属于较低等的真核生物，基因组较小；真菌基因组的测序将为真菌特性的分析提供有用的依据；随着新一代高通量技术的成熟，真菌基因组测序成本已大大降低。