外显子分析
外显子分析是指利用序列捕获技术将全部外显子区域的DNA 捕获并富集后再进行高通量测序，与全基因组重测序相比，更简便，经济，高效，可用于寻找复杂疾病如癌症，糖尿病，肥胖症等致病基因和易感基因等。
寡核苷酸的分析
随着分子生物学技术和反义核酸药物技术的发展，越来越多的寡核苷酸片段被合成，用以作引物、探针以及反义药物等。对这些片段进行快速检测，以判断合成的是否完全及合成的序列是否正确，是完全必要的。包括MALDI-TOF-MS在内的生物质谱是迄今为止进行这种检测最好的手段。
转录组测序
转录组（transcriptome）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。