Parallel Reaction Monitoring(PRM,平行反应监测技术)是一种针对目标蛋白检测的靶向质谱技术。通过对特异性肽段或目标肽段进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或绝对定量,具有高特异性、高通量、无需抗体等优势。相关应用解读,详情可点击:与WB互补的验证神器!6篇文献一次解锁『高通量靶向蛋白质检测技术PRM』的魅力!
4D-PRM在普通的PRM的基础上,利用离子淌度新一维的分离,提高了离子的选择性和灵敏度,并结合了PASEF的扫描速度优势,从而增加了靶标离子的数量。
自2022年推出4D-PRM蛋白质组学技术以来(详情可点击:4D-PRM新品| 吉凯靶向蛋白质组PRM技术全面升级,开启4D-PRM新时代!),吉凯基因再次对4D-PRM蛋白质技术进行了优化,方法建立成功率高达90%,一次实验可实现对100种蛋白质进行高通量验证。
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4D-PRM核心优势一
4D-PRM预实验可评价上千种蛋白质的方法建立成功率,成功率高达90%,绝大多数前组学差异结果均可通过4D-PRM验证
4D-PRM技术是对前组学结果的验证,但传统的PRM技术往往只能成功建立部分差异蛋白的PRM检测方法,因此这大大限制了PRM蛋白质组学技术的应用。此次吉凯基因对4D-PRM和4D-Label free蛋白质组学技术和流程进行了升级,例如:
1. 再也不用为怎么挑蛋白烦恼了:无需提前挑选正式实验要检测的蛋白质,可以等4D-PRM预实验结果出来后再挑选。
2. 4D-PRM方法成功率高达90%:无论前期是480或timsTOF平台上做的4D蛋白质组学,还是5D平台上的蛋白质组学数据,均可采用4D-PRM靶向验证,方法建立成功率在70~90%之间,平均在85%。
补充说明:目前无5D-PRM技术。因5D label free蛋白质组学技术检测到的蛋白质比4D蛋白质组学多,所以4D-PRM技术对5D结果验证时,方法建立成功率相比4D蛋白质组学有所下降,此为正常现象。
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4D-PRM核心优势二
更快的采集速度,一次实验可验证多达100种蛋白
得益于timsTOF Pro大于120Hz的MS/MS扫描速度,此次吉凯对4D-PRM技术升级之后,使得PRM-PASEF能够在短时间内可以同时定量多达100种蛋白质。相比传统PRM一次只能验证30种蛋白质而言,在相同分析时长下4D-PRM能以更快的扫描速度实现更多差异蛋白更高通量的验证。
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4D-PRM核心优势三
更高的离子选择性,定量更准确
在timsTOF Pro上,4D-PRM因为有离子淌度的分离,具有更强的选择性。离子过滤窗口(Ion Mobility Filter)处于关闭状态时,相同质荷比的离子不能有效区分,离子选择性弱。谱图存在明显的杂峰,定量准确性较低;相比之下,离子过滤窗口打开后,离子淌度能有效区分相同质荷比但形状和截面不同的离子,显著降低目标离子的背景,产生更强的离子选择性和更高的定量准确性。
传统PRM和4D-PRM技术性能差异总结
为了帮助各位老师更好的认识4D-PRM 100的产品特点,选择更适合的产品,我们对该产品和传统PRM和4D-PRM 30进行了梳理和总结,相关产品特点如下所示。如有相关需求,下单请联系吉凯当地销售工程师或者拨打客服热线4006210320,也可微信添加吉凯客服“jikaikefu”进行咨询。
吉凯基因凭借多年在靶标筛选及验证服务领域的技术积累,建立的标准化 、工程化 、系统化的GRP平台,为中国研究型医生提供科研服务,加快科研成果转化。其中,多组学平台包含蛋白质组学平台和高通量测序平台:
·蛋白质组学平台拥有多台timsTOF Pro、Exploris 480高精度质谱仪,专业的PaSER、Spectronaut Plusar等分析软件,提供专业的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修饰组、olink蛋白质组等检测服务,强大的机器学习算法、IPA分析、蛋白基因组分析服务,系统的生物标志物、分子分型、药物靶点、基因功能研究等解决方案,真正让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·高通量测序平台分为常规测序服务和单细胞测序服务:单细胞测序拥有10x和BD两个平台,提供单细胞RNA-seq、单细胞核测序、单细胞混样RNA-seq、单细胞TCR/BCR、单细胞(RNA+ATAC)、空间转录组测序等服务;常规测序服务提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修饰测序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙酰化修饰测序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻译组测序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全转录组测序(两文库/三文库)、外泌体miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服务。